Что нужно знать
- Файл FNA представляет собой файл выравнивания последовательностей ДНК и белков в формате FASTA.
- Откройте с помощью Geneious.
- Конвертировать в FASTA и подобные форматы с помощью той же программы.
В этой статье объясняется, что такое файл FNA, как его открыть и сохранить в другом формате, таком как FASTA, GB, VCF, изображения и т. д.
Что такое файл FNA?
Файл с расширением FNA представляет собой файл выравнивания ДНК и белков в формате FASTA, в котором хранится информация о ДНК, которая может использоваться программным обеспечением молекулярной биологии.
Файлы FNA, в частности, могут использоваться только для хранения информации о нуклеиновых кислотах, в то время как другие форматы FASTA содержат другую информацию, связанную с ДНК, например файлы с FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ., NET или расширения файлов AA.
Эти текстовые форматы FASTA изначально возникли из программного пакета с тем же названием, но теперь используются в качестве стандарта в приложениях для выравнивания последовательностей ДНК и белков.
FNA также относится к некоторым технологическим терминам, которые не имеют ничего общего с этим форматом файла, например, окончательное принятие сети, средство увеличения имени файла/атрибута, сетевая архитектура Fujitsu и реклама быстрого соседа.
Как открыть файл FNA
Откройте один в Windows, macOS и Linux с помощью Geneious (бесплатно в течение 14 дней). Для этого перейдите в меню Файл > Импорт и выберите импорт файла через Из файлапункт меню.
Вы также можете открыть его с помощью BLAST Ring Image Generator (BRIG).
Попробуйте Notepad++ или другой текстовый редактор, если эти идеи не работают. Файл действительно может быть текстовым и простым для чтения, или вы можете обнаружить, что он не имеет ничего общего с форматом FASTA, и в этом случае открытие файла как текстового документа может показать текст, который идентифицирует то, что было использовано для создания файла. или в каком формате находится файл.
Как преобразовать файл FNA
Мы не можем это проверить, так как не пробовали, но вы сможете использовать Geneious для преобразования файла во множество других форматов, таких как FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV и VCF. Это можно сделать через меню программы Файл > Экспорт.
Эта же программа также должна иметь возможность сохранять файл в PNG, JPG, EPS или PDF с помощью Файл > Сохранить как файл изображения.
Хотя обычно вы не можете просто переименовать расширение файла во что-то другое и ожидать, что оно будет работать таким же образом, вы можете переименовать файл. FNA в файл. FA, если ваше конкретное программное обеспечение для секвенирования ДНК будет распознавать только формат FA.
Вместо переименования расширений файлов вы можете использовать бесплатный конвертер файлов для преобразования файлов других типов. В случае с файлами FNA и FA так получилось, что некоторые программы будут открывать только файлы с расширением FA, и в этом случае переименование должно работать нормально.
Все еще не могу открыть?
Если после использования вышеуказанных программ вы по-прежнему не можете открыть файл, возможно, вы обнаружите, что расширение файла на самом деле не читается как. FNA, а вместо этого выглядит похоже.
Например, файлы FNG (Font Navigator Group) выглядят очень похоже на «. FNA», но если вы присмотритесь, то увидите, что совпадают только первые две буквы. Поскольку расширения файлов разные, это указывает на то, что они имеют другой формат файла и, скорее всего, не будут работать с одними и теми же программами.
То же самое можно сказать и о многих других расширениях файлов, таких как FAX, FAS (Compiled Fast-Load AutoLISP), FAT, FNTA (Aleph One Font), FNC (Vue Functions) и FND (Windows Saved Search).
Идея состоит в том, чтобы просто убедиться, что расширение файла читается как. FNA. Если это так, попробуйте снова использовать программы сверху, чтобы открыть или преобразовать его. Если у вас есть файл другого типа, изучите его расширение, чтобы узнать, какие приложения необходимы для его открытия или преобразования.
FAQ
Как открыть файл FNA в Python?
Сначала преобразуйте файл FNA в формат FASTA с помощью стороннего приложения, такого как Geneious. Затем вы можете загрузить Biopython, набор свободно доступных инструментов для биологических вычислений для работы в области биоинформатики. Наконец, обратитесь к учебнику и кулинарной книге Biopython для получения инструкций по работе с файлами FASTA.
Как мне найти свои номера производителя FNA в необработанном файле Ancestry?
Вы можете загрузить большинство данных ДНК с сайта Ancestry.com в формате.txt. Однако только клиенты, чья ДНК была проанализирована с помощью секвенирования нового поколения (NGS), имеют возможность загрузить файл VCF. Чтобы загрузить файл VCF, вы должны быть владельцем ДНК, пройти ДНК-тест с использованием технологии NGS и иметь не менее 350 МБ свободного места на вашем устройстве.
